Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Npas1P97459 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms