Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nbr1P97432 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nbr1P97432 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms