Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhodP97348 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhodP97348 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhodP97348 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhodP97348 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhodP97348 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhodP97348 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhodP97348 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhodP97348 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RhodP97348 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms