Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3f3aP84244 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms