Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgcdP82347 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgcdP82347 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgcdP82347 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgcdP82347 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgcdP82347 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SgcdP82347 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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