Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atf1P81269 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms