Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx1P81068 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx1P81068 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms