Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb1P70662 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb1P70662 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms