Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tbx6P70327 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms