Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tgif1P70284 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tgif1P70284 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms