Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp7P70280 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp7P70280 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms