Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrig1P70193 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrig1P70193 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms