Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actg1P63260 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Actg1P63260 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Actg1P63260 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms