Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnrpnP63163 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SnrpnP63163 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms