Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbdP63072 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbdP63072 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbdP63072 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UbdP63072 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbdP63072 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UbdP63072 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UbdP63072 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UbdP63072 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UbdP63072 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbdP63072 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbdP63072 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UbdP63072 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UbdP63072 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbdP63072 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbdP63072 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UbdP63072 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UbdP63072 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UbdP63072 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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