Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd2P62317 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd2P62317 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms