Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm3P62311 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms