Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap1s1P61967 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap1s1P61967 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms