Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Depdc5P61460 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Depdc5P61460 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Depdc5P61460 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms