Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf3P61205 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf3P61205 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms