Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PlnP61014 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PlnP61014 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PlnP61014 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PlnP61014 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PlnP61014 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PlnP61014 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PlnP61014 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PlnP61014 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PlnP61014 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms