Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap25P60879 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap25P60879 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snap25P60879 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snap25P60879 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms