Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P58686 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P58686 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P58686 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P58686 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P58686 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P58686 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P58686 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P58686 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P58686 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P58686 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P58686 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms