Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpaP58389 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpaP58389 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpaP58389 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpaP58389 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtpaP58389 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtpaP58389 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpaP58389 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpaP58389 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpaP58389 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpaP58389 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms