Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpdl3bP58242 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpdl3bP58242 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms