Protein–RNA interactions for Protein: P58006

Sesn1, Sestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sesn1P58006 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sesn1P58006 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sesn1P58006 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms