Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn18P56857 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn18P56857 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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