Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aqp4P55088 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms