Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad23bP54728 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms