Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RabggtbP53612 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RabggtbP53612 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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