Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms