Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fgd1P52734 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fgd1P52734 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms