Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2e3P52483 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms