Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr4P51680 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms