Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XpcP51612 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XpcP51612 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XpcP51612 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XpcP51612 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XpcP51612 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XpcP51612 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XpcP51612 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XpcP51612 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XpcP51612 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XpcP51612 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
XpcP51612 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XpcP51612 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XpcP51612 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XpcP51612 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XpcP51612 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XpcP51612 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XpcP51612 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XpcP51612 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XpcP51612 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XpcP51612 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XpcP51612 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms