Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa-rs12P50716 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa-rs12P50716 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms