Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prox1P48437 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prox1P48437 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prox1P48437 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms