Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox2P48432 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox2P48432 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sox2P48432 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms