Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Edn3P48299 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edn3P48299 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms