Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl11P48298 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl11P48298 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms