Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TgfaP48030 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TgfaP48030 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms