Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gli1P47806 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gli1P47806 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms