Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrprbP47758 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SrprbP47758 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SrprbP47758 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms