Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sipa1P46062 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sipa1P46062 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms