Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf5P43027 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms