Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sept1P42209 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sept1P42209 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sept1P42209 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 336.3 ms