Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Elk1P41969 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Elk1P41969 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms