Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms