Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf1P39428 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms