Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik2P39087 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik2P39087 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms